טיפול שורש נעשה באופן שגרתי כאשר ישנה שן בה העששת חדרה את זגוגית ושכבת הדנטין של השן והגיעה למוך השן, המורכב כלי דם ועצבים ולמעשה מהווה את רקמת השן הפנימית, או במצב בו נחשף מוך השן לזיהום בגלל פגיעה.
יש לבצע כמה שלבים בטיפול שורש:
• פתיחת השן וסילוק העששת.
• סילוק רקמת מוך השן וניקוי תעלות השורש.
• מילוי השן בחומר מיוחד ולאחר מכן סתימתה.
טיפול שורש נערך כמעט תמיד באמצעות הרדמה מקומית, אך לעיתים ניתן לבצעו ללא שימוש באלחוש מקומי, במקרה בו השן "מתה". צילום רנטגן הוא חובה, לפני טיפול שורש כדי לבדוק את מצב השן וממה היא נפגעה.
תוך כדי מתן הטיפול נוטים רופאי השיניים לצלם צילומים נוספים, בכדי לבחון את אורכן של תעלות השורש. עם סיום ניקוי התעלות, הן מוזנות באמצעות חומר סתימה מיוחד כדי לעצור חדירה והתרבות של חיידקים ובעצם למנוע דלקת. בסופו של התהליך סותמים את השן בצורה המוכרת.
שן לאחר טיפול שורש עשויה להיות חלשה יותר ויכולה להיות מועדת לשבירה. מסיבה זו כדאי להשלים את הכותרת תוך שימוש ביתד יצוקה או בורג באחת מתעלות השורש, ועליהם כתר.
הטיפול יכול להימשך לאורך מספר מפגשים. קיימים מקרים בהם ניתן לסיים את הטיפול בפגישה אחת, במיוחד במקרה בהם השן לא הייתה נמקית עם תחילת הטיפול.
